Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms