Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC25CP30307 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms