Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP1P29466 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP1P29466 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP1P29466 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP1P29466 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms