Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB2P29033 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB2P29033 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms