Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALB2P22676 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms