Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK11BP21127 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms