Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR1P18146 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR1P18146 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR1P18146 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms