Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAV1P15498 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAV1P15498 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAV1P15498 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms