Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
VPREB1P12018 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms