Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf88P0DMB2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms