Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC2BP0DI82 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms