Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPBP07199 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPBP07199 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPBP07199 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPBP07199 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPBP07199 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPBP07199 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPBP07199 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPBP07199 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPBP07199 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms