Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOA1P02647 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms