Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDNEP1O95476 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDNEP1O95476 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms