Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TIPRLO75663 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms