Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP2O75323 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms