Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRD4O60885 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRD4O60885 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRD4O60885 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRD4O60885 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRD4O60885 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRD4O60885 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD4O60885 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD4O60885 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD4O60885 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD4O60885 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRD4O60885 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms