Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBFA2T2O43439 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms