Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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NDUFS4O43181 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFS4O43181 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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