Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms