Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NOTOA8MTQ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms