Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VWA3AA6NCI4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VWA3AA6NCI4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms