Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB19A4D1S5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms