Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV30A0A0K0K1B3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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