Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf98P1-201ENST00000446114 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL361P-201ENST00000470785 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXL2-216ENST00000484457 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUSBP2-203ENST00000492832 801 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV1-5-201ENST00000496168 532 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139365.1-201ENST00000519417 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02321-201ENST00000555975 384 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL15P-201ENST00000582825 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020917.2-201ENST00000587343 401 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121928.1-201ENST00000608017 521 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV2D-29-202ENST00000612356 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC135048.3-201ENST00000614997 328 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC000041.2-201ENST00000619824 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FO538757.2-201ENST00000624431 570 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTAGE6-201ENST00000470691 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSG4-201ENST00000308128 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPAP1P4-201ENST00000443325 3310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMYD1-201ENST00000419482 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC12-201ENST00000314756 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 UST-201ENST00000367463 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC170-201ENST00000239374 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC85C-207ENST00000557769 3793 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF2-201ENST00000378164 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIDT2-203ENST00000431081 3910 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHAC1-202ENST00000409700 4077 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFP1-202ENST00000393430 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIX1-201ENST00000247182 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTRK3-220ENST00000626019 2741 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 INTS3-210ENST00000512605 3442 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TLR9-201ENST00000360658 3870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-274ENST00000641120 2456 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005264.8-201ENST00000623093 3313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL14A1-201ENST00000247781 3450 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHC2-204ENST00000431992 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PREX2-201ENST00000288368 10750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02554-201ENST00000426467 5052 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKNAD1-203ENST00000370001 3053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms