Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ8

KRTAP4-9, Keratin-associated protein 4-9, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-9Q9BYQ8 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 PARM1-201ENST00000307428 5011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ACTN4P2-201ENST00000473049 1892 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 BTN3A3-202ENST00000361232 2294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 POLR3B-201ENST00000228347 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TARID-209ENST00000630119 4294 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC01310-201ENST00000380981 4015 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 YPEL4-203ENST00000524669 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 FBXO8-201ENST00000393674 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 CD44-206ENST00000415148 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ARHGEF9-232ENST00000637417 5114 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 KCNA2-211ENST00000639233 5256 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 C1orf74-201ENST00000294811 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL592158.1-201ENST00000632210 4477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 SEMA6A-201ENST00000257414 4256 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 GRIK1-207ENST00000399914 3624 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 USP30-203ENST00000392784 2483 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 TRIM23-201ENST00000231524 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 CES5A-201ENST00000290567 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZNF559-206ENST00000587557 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC136628.1-201ENST00000503218 561 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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KRTAP4-9Q9BYQ8 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 DPPA5P2-201ENST00000561451 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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