Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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