Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFGEF1Q9Y6D6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms