Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms