Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FARP1Q9Y4F1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FARP1Q9Y4F1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms