Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
R3HCC1Q9Y3T6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HCC1Q9Y3T6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms