Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPR55Q9Y2T6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms