Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
USP20Q9Y2K6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms