Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RCE1Q9Y256 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms