Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIGD1AQ9Y241 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms