Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNQ9UQP3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNQ9UQP3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms