Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE2

RPH3AL, Rab effector Noc2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3ALQ9UNE2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPH3ALQ9UNE2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPH3ALQ9UNE2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPH3ALQ9UNE2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPH3ALQ9UNE2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms