Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNRD1Q9P1U0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms