Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAPAQ9P0L0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms