Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NKIRAS2Q9NYR9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms