Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTLC3Q9NUV7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms