Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms