Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TULP4Q9NRJ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms