Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN4Q9NQC3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms