Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms