Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ELL3Q9HB65 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELL3Q9HB65 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELL3Q9HB65 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELL3Q9HB65 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELL3Q9HB65 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELL3Q9HB65 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELL3Q9HB65 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms