Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLIRPQ9GZT3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms