Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIFKQ9BYG3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIFKQ9BYG3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms