Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms