Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP58Q9BVL2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms